根据《审计署办公厅关于印发长江上游水污染防治及资金管理使用情况专项审计调查工作方案》和省审计厅工作安排，在审计署的统一安排部署和指导下，审计署和贵州省审计厅联合对贵州省划入长江上游影响区范围的 7个市（州、地）和所辖有关县（市、区）2006年至2008年长江上游水污染防治及资金管理使用情况进行审计调查。除贵阳、毕节、遵义、铜仁由审计署郑州特派办组织审计调查外，贵州省审计厅认真组织力量，通过上审下和交叉审计的形式，于2009年4月13日至7月31日，对六盘水市、安顺市、黔南州三个市（州）本级和所辖的8个县（区）进行了审计调查。这次调查的主要内容和范围是长江上游水污染防治主要措施和效果、水质现状和变化趋势、水污染防治措施实施情况、项目建设和资金管理使用等情况，审计调查涉及的有财政、环保、发改、经贸、建设、城管、水利、水文、安监、统计、电力、给排水（供水）等管理单位及相关的项目实施单位。

　　经过审计调查表明，“十一五”期间，六盘水、安顺和黔南三个市（州）政府对长江上游水污染防治是认真重视的，都结合实际制定了相关政策，签订了责任书，落实了目标任务，制定了工作方案，采取了节能减排措施，淘汰了落后产能，加强了污水处理厂和垃圾填埋场建设，改善了环保设施和条件，加大了对环境的监测和治理力度，加强了对集中式饮用水源地的保护和水质情况的监控，维护了饮水安全，环境保护工作取得一定的成效。但是通过审计调查发现，三个市（州）境内长江上游水污染防治仍不容乐观，与《三峡规划》要求还有很大的差距。针对发现的问题，贵州省审计厅已向被审计单位提出审计意见，要求被审计单位对审计调查提出的问题在60日内加以整改。