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亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
在这个情境里，甲物业管理公司2018年购入门市时支付的5万元税费，指的是在购买该门市过程中产生的各类相关税费，像契税、印花税等。

处理方式上，这5万元税费通常会计入门市的购置成本。门市作为一项不动产，其成本涵盖购买价款以及为使门市达到可使用状态所发生的必要支出，所以这5万元税费会和购买门市支付的含税价款200万元一同构成该门市的入账价值。

理解时，可以把这5万元税费看作是为取得该门市所有权而付出的一部分代价。就如同购买一件商品，除了商品本身的价格，还可能有运输费、装卸费等其他费用，这些费用都要算到商品的总成本里。在后续对该门市进行会计核算、折旧计算或者转让等处理时，都是以包含这5万元税费的总成本作为基础的。
祝您学习愉快！