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亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
是的，需要计算增值税。

出口货物通常适用增值税“免抵退”政策，即免征增值税、抵扣进项税额、退还已纳税额。但是否适用该政策，需根据企业是否符合相关条件判断。

根据背景信息，出口自产水泥配料用粘土2000吨，若企业符合出口退税条件（如为增值税一般纳税人、出口货物为自产货物、未发生骗取退税等违规行为），则适用“免抵退”政策，无需缴纳增值税，但需按规定申报退税。

若企业不符合退税条件，则可能需按适用税率计算增值税销项税额。

因此，是否需要计算增值税，需结合企业是否符合“免抵退”政策的具体条件判断。
祝您学习愉快！