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3%的农产品专用专票可以抵扣9%进项！
在疫情期间，国家税务总局留言区曾有一条这样的提问：
当时官方给出的回复是这样的：
“销售农产品的小规模纳税人选择放弃享受减征增值税政策，开具3%征收率的增值税专用发票，你公司取得了小规模纳税人开具的3%征收率的增值税专用发票，即可按上述规定计算抵扣进项税额。”
如今，相关的答复暂未有什么改变，比如江苏税务在2023年3月关于取得农产品专票的抵扣问题：
也就是说，目前，取得农产品1%专票，不能按9%进行抵扣，但一般纳税人取得3%农产品专用发票，可以按照 9%计算扣除！
不过，由于各地税务机关执行口径可能存在差别，建议具体操作是还是要咨询一下当地的税务机关。
怎么计算抵扣？
举个简单的例子：A公司为增值税一般纳税人，取得小规模纳税人B公司开具的一张农产品专用发票，发票金额100000元，税额3000元。
那么，A公司可以抵扣的进项税= 100000*9%=9000（元）。
*此处是用不含税金额来计算进项税额。购进农产品用于深加工，还可以加计扣除1%。
再比如：
A公司在购入时，按9%计算抵扣进项税，领用进行深加工时（加工13%税率的货物），再加计1%进项税额。（即可以按照10%扣除）
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