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小规模纳税人在进行运费的会计处理时，需要根据具体情况进行分录，以下是两种可能的情况：
1. 小规模纳税人自己承担运费，且运费金额不含税：
借：运费费用账户
贷：银行存款账户
2. 小规模纳税人委托物流公司代付运费，且运费金额含税：

借：运费费用账户
贷：应付账款-物流公司账户
贷：进项税额-运费税额账户

需要注意的是，对于含税运费的情况，小规模纳税人需要同时计算和处理运费的增值税税额，将其分别计入应付账款和进项税额账户中。