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使用员工工资计算软件在线进行工资计算需要以下步骤：
1. 选择一款适合自己的员工工资计算软件，可以在网上搜索或者向同行咨询。
2. 在软件中输入员工的基本信息，如姓名、工号、部门等。
3. 输入员工的工资信息，包括基本工资、津贴、加班费、绩效奖金等。
4. 根据公司的规定和政策，选择相应的社保和公积金缴纳比例，并输入相关信息。
5. 根据员工的实际情况，选择个人所得税的计算方式，并输入相应信息。
6. 点击计算按钮，软件会自动计算出员工的实际工资和扣除项。
7. 根据计算结果，生成工资条并进行打印或导出。

需要注意的是，使用员工工资计算软件在线进行工资计算需要掌握一定的会计和税务知识，以确保计算的准确性和合法性。同时，还需要对公司的工资政策和法规有一定的了解，以便正确地设置软件的参数和选项。