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年终奖扣税的算法有两种，分别是一次性计算法和分期计算法。

一次性计算法：将年终奖的金额与上年累计收入相加，再按照税率表计算应缴纳的个人所得税，最后减去已缴纳的税款即为应扣税额。

分期计算法：将年终奖的金额按月份平均分摊到全年12个月中，然后再按照税率表计算每个月应缴纳的个人所得税，最后累加每个月的应扣税额即为应扣税额。

需要注意的是，根据个人所得税法的规定，每个人每年享有一定数额的免税额和专项扣除，可以在计算个人所得税时减免应缴纳的税款。