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小规模纳税人可以申请高新技术企业认定，但是需要满足以下条件：
1.企业应是小规模纳税人，即年销售额不超过5000万元；
2.企业所从事的产业应属于高新技术产业范畴；
3.企业应符合高新技术企业认定的其他条件，如研发投入、知识产权等。

需要注意的是，高新技术企业认定是由地方科技管理部门进行审核和认定的，不同地区的认定标准可能有所不同，具体可咨询当地科技管理部门。