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根据中国的个人所得税法规定，个人所得税是按照逐级累进税率计算的。超过5000元的部分需要缴纳个人所得税。

具体计算方法如下：
1. 首先，计算超过5000元的部分。假设超过5000元的金额为X元。
2. 根据当前的个人所得税税率表，确定适用的税率。目前中国个人所得税税率分为7个档次，税率从3%逐级增加到45%。
3. 根据适用的税率，计算超过5000元的部分需要缴纳的个人所得税。计算公式为：个人所得税=超过5000元的部分 × 适用税率。

举例说明：

假设超过5000元的金额为10000元，根据当前的个人所得税税率表，适用税率为20%。

个人所得税=（10000-5000）× 20% = 1000元

因此，超过5000元的部分需要缴纳1000元的个人所得税。