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小规模公司给各个商户开租金发票的税率并不是免税的。根据中华人民共和国税收法，当一个公司的一年度纳税额小于某一标准值时，就属于小规模纳税人，此时其开具租金发票所征收的税率纳入增值税一般征收率，即按照3%征收。另外，在开具租金发票时，除了本身的3%的增值税外，还需要支付附加税，包括教育费附加，地方教育费附加和城市维护建设税，具体的税率应该由所在的地方进行调整和规定。 在小规模纳税人给各个商户开具租金发票的同时，也应对本次交易进行增值税的纳税申报，这就要求小规模纳税人认真记录每一笔交易，并在每月末根据交易情况按照要求进行申报。 总而言之，小规模纳税人给各个商户开具租赁发票的时候，虽然不是免税的，但是根据当地的纳税义务人主动依法申报，增值税税负是可以极大减轻的。因此，大家需要熟悉相关税收规定以及纳税义务，以确保能够正确纳税、减税。