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小规模纳税人2022年第三季度，开具免税普票40万，5%征收率销售额10万，需要交税的增值税计算如下： 免税普票销售额40万，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第十六条规定，免税普票销售额需按照本期增值税税率3%计征增值税，即为：免税普票销售额×3%增值税税率=1.2万元。 收票销售额10万，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第十五条规定，收票销售额需按照本期增值税税率5%计算，即为：收票销售额×5%增值税税率=0.5万元。 总税金=免票销售额税金+收票销售额税金=1.2万元+0.5万元=1.7万元。 因此，小规模纳税人2022年第三季度，开具免税普票40万，5%征收率销售额10万，公司三季度应交增值税1.7万元。 此外，计算增值税时，纳税人还应根据《营改增税收征管暂行办法》，按税收分类核算，并体现税负发生尾数一致性。此外，在确定增值税的税率时，还应考虑是否有降低税率的条款。