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企业自建厂房增值税发票能够抵扣，具体的抵扣办法可以分为两种：本期抵扣和未来期抵扣。本期抵扣就是企业购买自建厂房时可以当期抵扣，即企业可以用这笔增值税发票抵扣当期应纳税额；未来期抵扣则是企业可以将本期购买自建厂房的增值税发票累计至申报纳税期次，以抵扣后续应纳税额。拓展知识：除此外，企业还可以在申报增值税的时候，把自建厂房的增值税作为减税额度，在纳税声明表或在减免税申报表中申报累计减免。