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小规模纳税人需要缴纳增值税，这是国家税收制度的一部分。根据国家有关规定，小规模纳税人每月可向税务机关报送主动申报的税款总额不超过5000元的，按照小规模纳税人备案管理办法的要求，应当向税务机关备案登记，并缴纳应税款。增值税是小规模纳税人必须缴付的税种，进项税是可以抵扣的，纳税人购买的货物或者接受的服务，可以从应纳税款中扣除相应的进项税额。比如：一家小规模纳税人提供物流辅助服务，为客户运送货物，发出的是物流辅助服务发票，此时，该企业应缴交的增值税为：应税销售额*3%（增值税税率）-购买运输、装卸、仓储服务的进行税额。