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所得税费用的缴纳方式主要有两种：一是按照企业所得税法规定的应纳税所得额和税率计算应纳所得税额，然后在税务机关规定的期限内缴纳税款；二是按照税务机关核定的应纳所得税额和缴纳方式缴纳税款。

具体来说，企业在按照企业所得税法规定的应纳税所得额和税率计算应纳所得税额后，需要在税务机关规定的期限内，通过银行转账、现金、支票等方式缴纳所得税款。一般来说，企业所得税的缴纳期限为每季度末的15日，年度末的3月31日。

如果企业的应纳所得税额无法按照企业所得税法规定的方式计算，或者需要调整已经计算好的应纳所得税额，那么就需要向税务机关申请核定。税务机关会根据企业的申请材料和实际情况，核定应纳所得税额，并规定缴纳方式和期限。企业需要按照规定的缴纳方式和期限缴纳所得税款。