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纸质银行承兑汇票和电子承兑汇票的主要区别在于形式和流转方式。
1. 形式：纸质银行承兑汇票是以纸质形式存在的，需要经过实体的签字和盖章等手续；而电子承兑汇票是以电子文件的形式存在的，可以通过电子签名和数字证书等方式进行认证。
2. 流转方式：纸质银行承兑汇票需要通过实体的传递方式进行流转，可能需要邮寄或亲自携带；而电子承兑汇票可以通过电子邮件、互联网或其他电子平台进行快速传递。

此外，纸质银行承兑汇票的流转过程中可能存在风险，如遗失或伪造，需要进行安全措施；而电子承兑汇票可以通过数字签名和加密等技术手段提高安全性。

总的来说，电子承兑汇票相较于纸质银行承兑汇票具有更快捷、便利和安全的特点，逐渐成为现代电子商务和金融交易中的主要支付工具。