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他去代开的时候交了1.5%的个税，我公司怎么计算扣，要做什么申报？劳务报酬吗？

按劳务报酬申报 比如运费5000 应税所得=5000*（1-20%）=4000 应交个税=4000*20%=800

代开时交了1%，这个要扣回吗？

我要在个税申报上代扣代缴吗？

有文件吗？我已经收了近100万的发票，这得扣多少税啊？

按照上面的思路计算就可以了

已经交的怎么扣回？

按规定，需要汇算清缴时申请退税了

我刚查了下百度，说税局已经按1%核定征收扣了税的，可以不代扣代缴？有这个说法吗？

《江西省地方税务局关于个人所得税征收管理有关问题的公告》：“（一）对依法不需要或尚未办理税务登记的临时从事生产经营的纳税人(有扣缴义务人的除外)，在代开增值税发票时，按照开票金额（不含税）的1.5%预征率预征个人所得税。非从事生产经营的个人取得劳务所得代开增值税发票时，应按照“劳务报酬所得”项目的法定税率征收个人所得税。（二）非生产、经营所得，应由支付所得的单位和个人依法代扣代缴个人所得税，扣缴义务人在向主管地方税务机关进行全员全额扣缴申报时，对纳税人在代开增值税发票环节已缴纳的个人所得税，应作为已缴税款予以抵减。（三）每年年度终了后三个月内，纳税人凭完税凭证到主管地税机关进行清算，多退少补”。

《湖北省地方税务局关于个人所得税征收管理有关问题的公告》：“（一）对依法不需要或尚未办理税务登记的零散税源户(有扣缴义务人的除外)，在从事生产、经营代开增值税发票时，按照纳税人开票金额（不含税）的1.5%预征率征收个人所得税。（二）对不属于生产、经营所得项目的所得，应由支付所得的单位和个人依法代扣代缴个人所得税，扣缴义务人在向主管地方税务机关进行全员全额扣缴申报时，对纳税人在代开增值税发票环节已按1.5%预征缴纳的个人所得税，应作为已缴税款予以抵减。（三）每年年度终了后三个月内，纳税人可以凭纳税凭证到当地地税部门核实清算，多退少补”。

《深圳市地方税务局关于个人所得税征收管理若干问题的公告》：“深圳市地方税务机关委托深圳市国家税务机关在对未办理税务登记证，临时从事生产、经营的零散税收纳税人（个人）代开增值税发票时，按纳税人开票金额的1.5%，代深圳市地方税务机关征收个人所得税核定税款。对不属于生产、经营性质，应由支付所得的单位和个人依法代扣代缴个人所得税的个人应税所得，扣缴义务人在向主管地税机关进行全员全额扣缴申报时，对纳税人在深圳市国家税务机关代开增值税发票环节已按1.5%核定缴纳的个人所得税，应作为已缴税款予以抵减”。

我是在新疆啊

各地规定大同小异的，具体可以再咨询一下当地税务局。

有新疆的老师吗？

新疆维吾尔自治区地方税务局关于《自治区地方税务局关于废止代开一体票个人所得税相关文件条款的公告》的政策解读：“依照《中华人民共和国个人所得税法》有关规定，个人取得税法规定的劳务报酬所得、财产租赁所得、财产转让所得的，应按照税法规定的费用减除标准、税率等缴纳个人所得税，税款由支付所得的单位和个人代扣代缴。为进一步规范和加强全区代开一体票个人所得税后续跟踪管理，自治区地方税务局对自行制定的代开一体票个人所得税相关文件进行了清理，对与税法规定不一致的部分文件条款决定予以废止”。

具体执行还要问一下当地税务局

运费确定属于劳务报酬所得嘛？

具体政策适用可以进一步咨询一下当地税务部门。