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根据中国税务部门的规定，90万元的普票工程款的个税应该按照以下要求计算： 1. 按照企业所得税法规定，当超过35万元时，企业应缴纳25%的所得税； 2. 按照国家有关部门规定，如果金额超过35万元，那么需要再支付1%的个人所得税，即90万元的普票工程款，需要缴纳2.25万元(25%+1%)的个税; 此外，需要注意的是，税务具有法定约束力，因此，缴纳个人所得税时，一定要严格依照税法规定的流程进行，才能保证自身的合法权益得到充分保护。 拓展知识：企业和个人在缴纳普票工程款时，都必须按照国家税法相关规定缴纳税款，具体税收种类和税费计算标准由主管税务机关规定。此外，不同地区也会有不同的政策规定，因此，企业和个人需要通过了解当地的政策，合理规避税收风险，以保证收入的稳定性和合法性。