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亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
是的，商业健康保险、税收递延型商业养老保险、个人养老金支出这三项扣除限额都可以纳入综合所得计算中。在具体处理时，这些项目会作为依法确定的其他扣除项从应纳税所得额中减除。例如：
假设某纳税人2025年的综合所得收入为12万元，已知“三险一金”等专项扣除为1.8万元，子女教育等专项附加扣除为1.2万元，符合条件的公益慈善事业捐赠为3000元。此外，该纳税人在这一年中还购买了商业健康保险支出2400元（年度限额），税收递延型商业养老保险支出6000元，个人养老金支出5000元。计算应退或应补税额时，这些扣除项将从综合所得收入中减除：\[\text{应纳税所得额}=120,000-60,000-18,000-12,000-3,000-2,400-6,000-5,000\]\[\text{应纳税所得额}=120,000-106,400=13,600\]然后根据适用税率和速算扣除数计算最终的税额。
祝您学习愉快！