公司备案事项的变更应当如何通知登记机关？

根据《中华人民共和国公司法》和《中华人民共和国公司登记管理条例》的规定，公司备案事项变更应当向原公司登记机关办理变更登记。具体程序如下：
1. 填写变更登记申请表：公司应当填写《公司变更登记申请表》，并提交到原公司登记机关。
2. 提交相关文件：公司应当提交变更事项的证明文件，如公司章程修正案、股东会决议、董事会决议等。
3. 缴纳变更登记费用：公司应当缴纳变更登记的费用。
4. 等待审核：公司登记机关对变更登记申请进行审核。
5. 领取变更后的营业执照：审核通过后，公司可以领取变更后的营业执照。

需要注意的是，不同类型的公司变更备案事项可能需要提交的文件和程序略有不同，具体以公司登记机关的要求为准。如果公司涉及到的变更事项比较复杂或者涉及到法律、法规的特殊规定，建议咨询专业律师或者公司注册代理机构。