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是的，一般纳税人取得小规模纳税人开具的专票，仍然应按照13%的税率来进行抵扣，而不是按照小规模纳税人的3%的税率来抵扣。这是因为，小规模纳税人的税率适用的是增值税一般纳税人抵扣进项税，只能按照13%的税率。拓展知识：据《税收征管法》第三十六条规定，小规模纳税人可以在开具发票时申请减按3%税率征收增值税，但在一般纳税人抵扣进项税时，仍然应按照13%的税率进行抵扣。